Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
9230113P08RikD3YWX3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
9230113P08RikD3YWX3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
9230113P08RikD3YWX3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
9230113P08RikD3YWX3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
9230113P08RikD3YWX3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
9230113P08RikD3YWX3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
9230113P08RikD3YWX3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
9230113P08RikD3YWX3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
9230113P08RikD3YWX3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
9230113P08RikD3YWX3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
9230113P08RikD3YWX3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
9230113P08RikD3YWX3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
9230113P08RikD3YWX3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms