Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrc5C3VPR6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrc5C3VPR6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrc5C3VPR6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms