Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc22a28B2RT89 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc22a28B2RT89 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms