Protein–RNA interactions for Protein: B0QZF7

Proca1, Protein PROCA1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proca1B0QZF7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Proca1B0QZF7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Proca1B0QZF7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Proca1B0QZF7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Proca1B0QZF7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Proca1B0QZF7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Proca1B0QZF7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Proca1B0QZF7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Proca1B0QZF7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Proca1B0QZF7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Proca1B0QZF7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Proca1B0QZF7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Proca1B0QZF7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Proca1B0QZF7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Proca1B0QZF7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Proca1B0QZF7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Proca1B0QZF7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Proca1B0QZF7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Proca1B0QZF7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms