Protein–RNA interactions for Protein: A9C473

A630010A05Rik, RIKEN cDNA A630010A05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630010A05RikA9C473 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A630010A05RikA9C473 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A630010A05RikA9C473 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A630010A05RikA9C473 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A630010A05RikA9C473 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A630010A05RikA9C473 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A630010A05RikA9C473 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A630010A05RikA9C473 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A630010A05RikA9C473 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A630010A05RikA9C473 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A630010A05RikA9C473 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A630010A05RikA9C473 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A630010A05RikA9C473 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A630010A05RikA9C473 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A630010A05RikA9C473 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214 ms