Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam43bA2AM80 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam43bA2AM80 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms