Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zkscan16A2ALW2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zkscan16A2ALW2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zkscan16A2ALW2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zkscan16A2ALW2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zkscan16A2ALW2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Zkscan16A2ALW2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Zkscan16A2ALW2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zkscan16A2ALW2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zkscan16A2ALW2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zkscan16A2ALW2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zkscan16A2ALW2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zkscan16A2ALW2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zkscan16A2ALW2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zkscan16A2ALW2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zkscan16A2ALW2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zkscan16A2ALW2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zkscan16A2ALW2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Zkscan16A2ALW2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zkscan16A2ALW2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zkscan16A2ALW2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zkscan16A2ALW2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zkscan16A2ALW2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zkscan16A2ALW2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zkscan16A2ALW2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zkscan16A2ALW2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms