Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms