Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc163A2AGD7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc163A2AGD7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms