Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calcoco2A2A6M5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms