Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3238W4VSP7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms