Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ubl3Q9Z2M6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ubl3Q9Z2M6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ubl3Q9Z2M6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ubl3Q9Z2M6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ubl3Q9Z2M6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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