Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms