Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms