Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms