Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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