Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni1Q9WUZ5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms