Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13bQ9WU72 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms