Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms