Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv2Q9WTR1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms