Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms