Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubd1Q9R1K7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms