Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec4eQ9R0Q8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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