Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms