Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms