Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

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Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sh2d3cQ9QZS8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sh2d3cQ9QZS8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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