Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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