Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms