Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PnckQ9QYK9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PnckQ9QYK9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PnckQ9QYK9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PnckQ9QYK9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PnckQ9QYK9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PnckQ9QYK9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PnckQ9QYK9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PnckQ9QYK9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms