Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms