Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf354bQ9QXT9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf354bQ9QXT9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms