Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms