Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms