Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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