Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SrfQ9JM73 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SrfQ9JM73 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SrfQ9JM73 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SrfQ9JM73 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SrfQ9JM73 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SrfQ9JM73 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SrfQ9JM73 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrfQ9JM73 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SrfQ9JM73 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SrfQ9JM73 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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SrfQ9JM73 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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SrfQ9JM73 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SrfQ9JM73 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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