Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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