Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms