Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CtsmQ9JL96 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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CtsmQ9JL96 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CtsmQ9JL96 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CtsmQ9JL96 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CtsmQ9JL96 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CtsmQ9JL96 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CtsmQ9JL96 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CtsmQ9JL96 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CtsmQ9JL96 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CtsmQ9JL96 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CtsmQ9JL96 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CtsmQ9JL96 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CtsmQ9JL96 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtsmQ9JL96 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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