Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ybx3Q9JKB3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms