Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms