Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6bQ9JK83 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms