Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Cngb3Q9JJZ9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cngb3Q9JJZ9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cngb3Q9JJZ9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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