Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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