Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms