Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Riox1Q9JJF3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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