Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC6

Rilpl1, RILP-like protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rilpl1Q9JJC6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rilpl1Q9JJC6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rilpl1Q9JJC6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rilpl1Q9JJC6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rilpl1Q9JJC6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rilpl1Q9JJC6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rilpl1Q9JJC6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rilpl1Q9JJC6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rilpl1Q9JJC6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rilpl1Q9JJC6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rilpl1Q9JJC6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rilpl1Q9JJC6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rilpl1Q9JJC6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rilpl1Q9JJC6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rilpl1Q9JJC6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rilpl1Q9JJC6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Rilpl1Q9JJC6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rilpl1Q9JJC6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rilpl1Q9JJC6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rilpl1Q9JJC6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rilpl1Q9JJC6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rilpl1Q9JJC6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rilpl1Q9JJC6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rilpl1Q9JJC6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rilpl1Q9JJC6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms