Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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