Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms