Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lima1Q9ERG0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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