Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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